Мухаммад ибн Али (Ханафий) — третий сын имама Али, на счет его происхождения есть много споров и противоречий:

• 1. В одном из боевых походов Али одерживает победу над царицей Ханафия, которая правила городом под названием Рум (не путать с Римом). Этот город был столицей государства, находившегося на территории современных Ирана и Ирака. Царица ставит условие Али: "Если одержишь в борьбе со мной победу, выйду за тебя замуж и приму со своим народом твою религию". Али одерживает победу и женится на ней, впоследствии сын от этого брака был назван в честь дедушки и матери.
• 2. Второй женой Али была девушка по имени Анифа (Ханафия), приемная дочь пророка и в честь деда и ее назван внук.(?)
• 3. По арабской версии, он является внуком Хасана. Его мать была персиянкой. Есть версия что ее звали Ханафия и поэтому его звали Мухаммад Ханафия.
• 4. После смерти пророка объявились несколько лжепророков, одним из самых влиятельных был Мусайлима из племени Бани Ханифа. Али начал с ними войну, обитали они на юге Саудовской Аравии. В одной из битв с племенем Бани Ханифа, Али досталась наложница из этого племени, от которой впоследствий родился сын. Она не была царицей или дочерью шейхов этого племени, была просто из этого племени.

Одними из активных распространителей Ислама в Средней Азий являются потомки Мухаммада ибн Али. Его потомки Абд ар-Рахим Баб (Карахан ата), Исхак Баб и Абд ал-Жалил Баб (Хорасан Саман Шах). Далее от них, от Исхак Баба: Акходжа, Аккорганходжа, Баксайыс ходжа, Диуана ходжа, От Абд Ар Рахим Баба: Карахан ходжа, Аулие ата ходжа, От Абд Жалил Баба: Хорасан ходжа, Кылыш ходжа.

Потомки этих миссионеров проживают в основном в Средней Азии, являясь членами рода кожа.