Rosetta@Home — проект добровольных вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершённому проекту «Геном человека» известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, не существующих белков. Хотя большая часть проекта ориентируется к фундаментальные исследования в области улучшения точности и надежности методов протеомики, Rosetta@home также способствует прикладным исследованиям для борьбы с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями^[2]. Foldit — это видеоигра от Rosetta@Home, которая стремится достигать целей проекта с краудсорсинг подходом.

Результаты вычислений Rosetta@Home не доступны напрямую. Так же, нельзя использовать результаты вычислений собственного компьютера.^[3] Однако они используются для большого количества научных публикаций.^[4]

По сути Rosetta — это компьютерная программа, основными задачами которой являются:

• поиск структуры с наименьшей энергией для заданной аминокислотной последовательности для предсказания структуры белка;
• решение обратной задачи — поиск аминокислотной последовательности с наименьшей энергией для заданной белковой структуры;
• расчёт взаимодействия комплекса белок-белок.

В данном проекте используется обратная связь по прогнозированию и полученным результатам, чтобы улучшать потенциальные функции и алгоритмы поиска.

Robetta

Robetta. На сайте проекта любой может запустить расчёт белков. Робетта использует тот же софт, что и Rosetta@home, но не использует ресурсы участников (это планируется в будущем)^[5]. Результаты расчётов доступны для скачивания не только запустившему задачу, но и любому желающему, однако хранятся на сервере всего неделю.^[6]

Результаты, полученные проектом Робетта на данный момент могут быть использованы только в образовательных и исследовательских целях. Для коммерческого использования (например, для изготовления лекарств)^[7] предлагается лицензировать rosetta и запускать на собственном оборудовании.

Примечания