Цис-элемент (цис-регуляторный элемент) — участок ДНК или РНК, который регулирует экспрессию генов, локализованных на той же молекуле ДНК (хромосоме). Цис-элементы обычно являются местами связывания одного или нескольких регуляторных белков (транс-факторами), кодируемых другими генами. Цис-элементы могут располагаться в 5'-концевом участке гена (в области промотора), в 3'-концевом участке (на нетранслируемых участках), а также в интронах.

Примерами цис-элементов могут служить IRES, TATA-бокс, фреймшифт-элемент.