Военный губернатор — правительственный чиновник в губернии царской России.

Военный губернатор назначался для управления губернией, областью, городом или крепостью, а в военное время — для управления областью, занятою по праву войны. В подведомственной ему местности он исполнял как гражданское, так и военное управление. При военном губернаторе не полагалось никаких совещательных учреждений. Военные губернаторы большею частью управляли губерниями и областями, входящими в состав генерал-губернаторств. Таковы: Кутаисская губ. и области Дагестанская и Карсская за Кавказом; Приморская, Амурская и Забайкальская области Приамурского генерал-губернаторства; Семипалатинская и Семиреченская области Степного генерал-губернаторства; области Сырдарьинская, Ферганская и Самаркандская — в Туркестане. Военными губернаторами управлялись, но в состав генерал-губернаторств не входили области Уральская и Тургайская; правами военных губернаторов пользовались также начальники Закаспийской области и острова Сахалина. Главный командир Кронштадтского порта считался военным губернатором г. Кронштадта. Сюда же относились различные области казачьих войск, имеющие особое военное управление под начальством наказных атаманов. Прежде губернаторы из числа военных в Европейской России именовались обыкновенно военными губернаторами губернского города и гражданскими губернаторами губернии.